MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 59475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021030	GCC	2	6	16	21	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185171
2	NC_021030	GAC	2	6	109	114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185171
3	NC_021030	TCTTTG	2	12	122	133	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479185171
4	NC_021030	AGAAC	2	10	147	156	60 %	0 %	20 %	20 %	479185171
5	NC_021030	TGC	2	6	165	170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185171
6	NC_021030	ATG	2	6	6120	6125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185172
7	NC_021030	A	7	7	6129	6135	100 %	0 %	0 %	0 %	479185172
8	NC_021030	CCT	2	6	6143	6148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185172
9	NC_021030	CTG	2	6	6165	6170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185172
10	NC_021030	CGC	2	6	6173	6178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185172
11	NC_021030	T	6	6	6182	6187	0 %	100 %	0 %	0 %	479185172
12	NC_021030	CGA	2	6	6212	6217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185172
13	NC_021030	CTT	2	6	6255	6260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185172
14	NC_021030	CCGCA	2	10	6326	6335	20 %	0 %	20 %	60 %	479185172
15	NC_021030	CGCTGG	2	12	6385	6396	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479185172
16	NC_021030	CG	3	6	6397	6402	0 %	0 %	50 %	50 %	479185172
17	NC_021030	CGG	2	6	6421	6426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185172
18	NC_021030	GCG	2	6	6439	6444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185172
19	NC_021030	CGG	2	6	6482	6487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185172
20	NC_021030	TCG	2	6	6514	6519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185172
21	NC_021030	AGG	2	6	6559	6564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185172
22	NC_021030	GCC	2	6	6582	6587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185172
23	NC_021030	CGG	2	6	6599	6604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185172
24	NC_021030	GC	3	6	6652	6657	0 %	0 %	50 %	50 %	479185172
25	NC_021030	TGC	2	6	6694	6699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185172
26	NC_021030	GCT	2	6	6764	6769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185172
27	NC_021030	GCG	2	6	6784	6789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185172
28	NC_021030	CCGATG	2	12	6852	6863	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479185172
29	NC_021030	CTG	2	6	6876	6881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185172
30	NC_021030	GCGCT	2	10	6900	6909	0 %	20 %	40 %	40 %	479185172
31	NC_021030	GCG	2	6	6953	6958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185172
32	NC_021030	CAA	2	6	6989	6994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479185172
33	NC_021030	CGT	2	6	7001	7006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185172
34	NC_021030	CG	3	6	7103	7108	0 %	0 %	50 %	50 %	479185172
35	NC_021030	GCA	2	6	7111	7116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185172
36	NC_021030	CGA	2	6	7157	7162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185172
37	NC_021030	CGA	2	6	7177	7182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185172
38	NC_021030	CGC	2	6	7222	7227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185172
39	NC_021030	CCG	2	6	7261	7266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185172
40	NC_021030	GGT	2	6	7271	7276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479185172
41	NC_021030	GCG	2	6	7414	7419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185172
42	NC_021030	GCC	2	6	7446	7451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185172
43	NC_021030	GGC	2	6	7463	7468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185172
44	NC_021030	CGG	2	6	7475	7480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185172
45	NC_021030	CCG	2	6	7493	7498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185172
46	NC_021030	ACG	2	6	7507	7512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185172
47	NC_021030	CGT	2	6	7513	7518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185172
48	NC_021030	CGGC	2	8	7534	7541	0 %	0 %	50 %	50 %	479185172
49	NC_021030	GAG	3	9	7608	7616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185172
50	NC_021030	TCG	2	6	7638	7643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185172
51	NC_021030	AAG	2	6	7644	7649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185172
52	NC_021030	GGC	2	6	7756	7761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185172
53	NC_021030	TGA	2	6	7765	7770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185172
54	NC_021030	CTG	2	6	7815	7820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185172
55	NC_021030	CCG	2	6	7864	7869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185172
56	NC_021030	TGA	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185172
57	NC_021030	GCC	2	6	7944	7949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185172
58	NC_021030	GAC	2	6	8012	8017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185172
59	NC_021030	CTG	2	6	8021	8026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185172
60	NC_021030	GCC	2	6	8066	8071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185172
61	NC_021030	TAC	2	6	8085	8090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185172
62	NC_021030	GCC	2	6	8120	8125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185172
63	NC_021030	ATC	2	6	8175	8180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185172
64	NC_021030	TGG	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479185172
65	NC_021030	GCA	2	6	8231	8236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185172
66	NC_021030	CGA	2	6	8294	8299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185172
67	NC_021030	CGA	2	6	8378	8383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185172
68	NC_021030	GCCT	2	8	13252	13259	0 %	25 %	25 %	50 %	479185173
69	NC_021030	GCC	2	6	13261	13266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185173
70	NC_021030	GCC	2	6	13282	13287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185173
71	NC_021030	CGA	2	6	13326	13331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185173
72	NC_021030	CTGGG	2	10	13333	13342	0 %	20 %	60 %	20 %	479185173
73	NC_021030	GCC	2	6	13396	13401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185173
74	NC_021030	TGA	2	6	13463	13468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185173
75	NC_021030	GAA	2	6	13543	13548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185173
76	NC_021030	CGC	2	6	13569	13574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185173
77	NC_021030	CG	3	6	13591	13596	0 %	0 %	50 %	50 %	479185173
78	NC_021030	TCG	2	6	13598	13603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185173
79	NC_021030	TAT	2	6	13636	13641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479185173
80	NC_021030	GC	3	6	13685	13690	0 %	0 %	50 %	50 %	479185173
81	NC_021030	CGA	2	6	13755	13760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185173
82	NC_021030	CGAC	2	8	13769	13776	25 %	0 %	25 %	50 %	479185173
83	NC_021030	G	6	6	13807	13812	0 %	0 %	100 %	0 %	479185173
84	NC_021030	TTC	2	6	13831	13836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185173
85	NC_021030	CGC	2	6	13920	13925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185173
86	NC_021030	GGAGC	2	10	14013	14022	20 %	0 %	60 %	20 %	479185173
87	NC_021030	CGG	2	6	14064	14069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185173
88	NC_021030	CGG	2	6	14085	14090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185173
89	NC_021030	GC	3	6	14099	14104	0 %	0 %	50 %	50 %	479185173
90	NC_021030	GCG	2	6	14209	14214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185173
91	NC_021030	TCG	2	6	14216	14221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185173
92	NC_021030	CGC	2	6	14238	14243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185173
93	NC_021030	ACG	2	6	14276	14281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185173
94	NC_021030	CG	3	6	14327	14332	0 %	0 %	50 %	50 %	479185173
95	NC_021030	GCG	2	6	14348	14353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185173
96	NC_021030	CGG	2	6	14354	14359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185173
97	NC_021030	GCG	2	6	14363	14368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185173
98	NC_021030	CG	3	6	14398	14403	0 %	0 %	50 %	50 %	479185173
99	NC_021030	TAT	2	6	14431	14436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479185173
100	NC_021030	TGC	2	6	14478	14483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185173
101	NC_021030	CAT	2	6	14508	14513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185173
102	NC_021030	GGGCA	2	10	14557	14566	20 %	0 %	60 %	20 %	479185173
103	NC_021030	AGG	2	6	14567	14572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185173
104	NC_021030	GAT	2	6	14689	14694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185174
105	NC_021030	TGC	2	6	14774	14779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185174
106	NC_021030	CGC	2	6	14819	14824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185174
107	NC_021030	AGC	2	6	14830	14835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185174
108	NC_021030	CGCGA	2	10	15064	15073	20 %	0 %	40 %	40 %	479185174
109	NC_021030	ACC	2	6	15208	15213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185174
110	NC_021030	TCG	2	6	15247	15252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185174
111	NC_021030	TCA	2	6	15263	15268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185174
112	NC_021030	TGA	2	6	15308	15313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185174
113	NC_021030	TCC	2	6	15430	15435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185174
114	NC_021030	ATG	2	6	15442	15447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185174
115	NC_021030	TTC	2	6	15495	15500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185174
116	NC_021030	C	9	9	15521	15529	0 %	0 %	0 %	100 %	479185174
117	NC_021030	CGA	2	6	15620	15625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185174
118	NC_021030	TTC	2	6	15676	15681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185174
119	NC_021030	AGA	2	6	15686	15691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185174
120	NC_021030	GCGGG	2	10	15714	15723	0 %	0 %	80 %	20 %	479185174
121	NC_021030	CGT	2	6	15734	15739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185174
122	NC_021030	CGTC	2	8	15759	15766	0 %	25 %	25 %	50 %	479185174
123	NC_021030	GTC	3	9	15771	15779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185174
124	NC_021030	GGA	2	6	15788	15793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185174
125	NC_021030	CAG	2	6	15963	15968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185174
126	NC_021030	CGG	2	6	15985	15990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185174
127	NC_021030	AGC	2	6	16030	16035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185174
128	NC_021030	AGC	2	6	16051	16056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185174
129	NC_021030	TCA	2	6	16073	16078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185174
130	NC_021030	GAT	2	6	16122	16127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185174
131	NC_021030	GAA	2	6	16188	16193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185174
132	NC_021030	CTT	2	6	16224	16229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185174
133	NC_021030	GCC	2	6	16238	16243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185174
134	NC_021030	GGA	2	6	16244	16249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185174
135	NC_021030	GCG	2	6	16261	16266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185174
136	NC_021030	CAG	2	6	16272	16277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185174
137	NC_021030	CAG	2	6	16284	16289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185174
138	NC_021030	CGT	2	6	16376	16381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185174
139	NC_021030	ACCG	2	8	16605	16612	25 %	0 %	25 %	50 %	479185174
140	NC_021030	CGA	2	6	16641	16646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185174
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142	NC_021030	TTG	2	6	16669	16674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185174
143	NC_021030	AGT	2	6	16697	16702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185174
144	NC_021030	GAA	3	9	16722	16730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185174
145	NC_021030	CGA	2	6	16752	16757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185174
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147	NC_021030	TTGG	2	8	16845	16852	0 %	50 %	50 %	0 %	479185174
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149	NC_021030	GTA	2	6	16893	16898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185174
150	NC_021030	GTC	2	6	16917	16922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185174
151	NC_021030	CGC	2	6	16982	16987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185174
152	NC_021030	GTC	2	6	17034	17039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185174
153	NC_021030	GGCG	2	8	17040	17047	0 %	0 %	75 %	25 %	479185174
154	NC_021030	TCG	2	6	17062	17067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185174
155	NC_021030	GAC	2	6	17343	17348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185174
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157	NC_021030	TCA	2	6	17366	17371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185174
158	NC_021030	CAG	2	6	17400	17405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185174
159	NC_021030	GTC	2	6	17406	17411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185174
160	NC_021030	GTT	2	6	17436	17441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185174
161	NC_021030	GCGG	2	8	17448	17455	0 %	0 %	75 %	25 %	479185174
162	NC_021030	TGGT	2	8	17458	17465	0 %	50 %	50 %	0 %	479185174
163	NC_021030	CGT	2	6	17537	17542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185174
164	NC_021030	CGT	3	9	17588	17596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185174
165	NC_021030	CGC	2	6	17639	17644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185174
166	NC_021030	GCC	2	6	17667	17672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185174
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169	NC_021030	GAA	3	9	17754	17762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185174
170	NC_021030	CCG	2	6	17802	17807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185174
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172	NC_021030	CAG	2	6	17928	17933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185174
173	NC_021030	CGA	2	6	17951	17956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185174
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175	NC_021030	GGT	2	6	18035	18040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479185174
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177	NC_021030	CGC	2	6	18077	18082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185174
178	NC_021030	GCC	2	6	18120	18125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185174
179	NC_021030	CTC	2	6	18132	18137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185174
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199	NC_021030	CGG	2	6	20884	20889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185175
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238	NC_021030	GTA	2	6	22539	22544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185176
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242	NC_021030	T	6	6	22638	22643	0 %	100 %	0 %	0 %	479185176
243	NC_021030	CGGT	2	8	22679	22686	0 %	25 %	50 %	25 %	479185176
244	NC_021030	GCC	2	6	22720	22725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185176
245	NC_021030	TTG	2	6	22726	22731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185176
246	NC_021030	CAC	2	6	22755	22760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185176
247	NC_021030	TGA	2	6	22865	22870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185176
248	NC_021030	CGGCC	2	10	22883	22892	0 %	0 %	40 %	60 %	479185176
249	NC_021030	CGT	2	6	22910	22915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185176
250	NC_021030	GTT	2	6	22941	22946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185176
251	NC_021030	CGG	2	6	23057	23062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185176
252	NC_021030	CGT	2	6	23081	23086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185176
253	NC_021030	ACGA	2	8	23089	23096	50 %	0 %	25 %	25 %	479185176
254	NC_021030	CGCC	2	8	23127	23134	0 %	0 %	25 %	75 %	479185176
255	NC_021030	TGTCGG	2	12	23156	23167	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	479185176
256	NC_021030	CAC	2	6	23193	23198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185176
257	NC_021030	TCC	2	6	23230	23235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185176
258	NC_021030	AGG	2	6	23309	23314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185176
259	NC_021030	CGT	2	6	23324	23329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185176
260	NC_021030	TCA	2	6	23336	23341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185176
261	NC_021030	CAG	2	6	23352	23357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185176
262	NC_021030	GCG	2	6	23393	23398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185176
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264	NC_021030	AGT	2	6	23429	23434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185176
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285	NC_021030	GCC	2	6	24232	24237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185176
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287	NC_021030	GCT	2	6	24269	24274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185176
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289	NC_021030	CCG	2	6	24292	24297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185176
290	NC_021030	GTC	2	6	24333	24338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185176
291	NC_021030	GCC	2	6	24361	24366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185176
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295	NC_021030	GCCG	2	8	24515	24522	0 %	0 %	50 %	50 %	479185177
296	NC_021030	GCC	3	9	24527	24535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185177
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339	NC_021030	CGGG	2	8	27029	27036	0 %	0 %	75 %	25 %	479185178
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372	NC_021030	GGA	2	6	28384	28389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185178
373	NC_021030	CGT	2	6	28459	28464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185178
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375	NC_021030	GC	3	6	28524	28529	0 %	0 %	50 %	50 %	479185178
376	NC_021030	GTT	2	6	28562	28567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185178
377	NC_021030	GTA	2	6	28571	28576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185178
378	NC_021030	TTG	2	6	28611	28616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185178
379	NC_021030	GTC	2	6	28788	28793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185178
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381	NC_021030	GAA	2	6	28963	28968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185179
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499	NC_021030	TCG	2	6	34227	34232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185181
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